吐蕃宣慰司是元朝在藏区设立的军政合一管理机构，隶属中央宣政院管辖。该机构始设于元宪宗蒙哥时期（1251 1259年），治所位于河州（今甘肃临夏）。至元六年（1269年）正式确立为吐蕃等处宣慰司都元帅府，管辖范围涵盖今甘肃、青海、四川及西藏东部地区。机构设置包含宣慰司、都元帅府、招讨司三大系统，形成军政合一的特殊管理体系。至元二十五年（1288年）后，原辖区分设为乌思藏纳里速古鲁孙、吐蕃等处、吐蕃等路三宣慰使司都元帅府，成为元代治理西藏的核心建制。

元宪宗蒙哥时期在河州设立吐蕃宣慰司都元帅府，初属总制院（后改宣政院）直辖。至元初年（约1264年后）正式改组为吐蕃等处宣慰司都元帅府，治所仍驻河州。至元二十五年（1288年），元廷将乌思藏、阿里三围地区析出，单独设立乌思藏纳里速古鲁孙等三路宣慰使司都元帅府，形成三司并立格局。终元之世，吐蕃宣慰司作为中央管理藏区的最高军政机构持续运作。

机构由三大系统构成：

该机构军政长官多由蒙古贵族或萨迦派高僧兼任，实行土流参用制度。至元二十五年（1288年）后确立'军民通摄'原则，强化对藏区驿站、司法管控。

最终形成三大辖区：

行省-宣慰司

该机构标志着西藏正式纳入中央王朝行政体系：