台阁制，是东汉光武帝开创的政体。东汉鉴于西汉末三公权势太大，就出现了台阁制。自此三公失权，事归台阁，成为尚书台掌实权的行政体系。

东汉时期，尚书台的机构更加完善，职权范围不断扩大，实际上已成为辅佐君主决策与发号施令的机构。当时以太尉、司空、司徒为“三公”，三公官职虽高，却并无实权。时人指出：光武帝“愠数世之失权，忿强臣之窃命，矫枉过直，政不任下，虽置三公，事归台阁。自此以来，三公之职，备员而已”(《后汉书·仲长统传》)。所谓“台阁”，即指尚书台。

光武帝继续实行西汉晚期“罢中书宦官”的规定，将宦官排除在尚书中枢政务之外。与西汉汉武帝到汉元帝时期以宦官典领尚书事不同，东汉时期尚书台纯以士人任职，宦官已无法染指尚书事。

尚书令设一人，俸禄为一千石，掌管凡选署及奏下六曹尚书的文书众事。

尚书仆射设一人，俸禄为六百石。部署尚书事务，当尚书令不在时，则由尚书仆射奏下众事。

尚书六人，俸禄为六百石。

光武帝以三公曹掌管岁尽考课诸州郡的事务，改西汉常侍曹为吏部曹，掌管选举、祠祀务；民曹掌管缮修、功作、盐池、园苑事务，客曹掌管护驾、羌胡朝贺事务；二千石曹掌管辞讼事务，中都官曹掌管水火、盗贼事务，合为六曹。

六曹尚书与尚书令、尚书仆射并称“八座”。

尚书六人虽有“曹”之名，但不以之为号。直到汉灵帝以侍中梁鹄为选部（吏部）尚书，于此始见“曹”名。

尚书台还设有尚书左丞和尚书右丞，俸禄均为四百石，负责记录文书期会。尚书左丞掌管吏民章报与驺、伯史。尚书右丞掌管印绶及纸笔墨、诸财用、库藏。

尚书侍郎共三十六人，俸禄为四百石，负责在尚书六曹中工作，六曹中每曹都有六名尚书侍郎，负责写文书、起草。

尚书台还设有令史十八人，俸禄为二百石，在尚书六曹中工作，六曹中每曹都有3名令史，负责整理文书。

汉明帝时期，为每位尚书郎配备伯史一人、女侍史二人，伯史选端正者，女侍史选妖丽者担任，负责管理香炉与衣服。

台阁制的设立，加强了皇权，缓和了阶级矛盾，为光武中兴和明章之治奠定了坚实的政治基础。

台阁制中，尚书台是尚书省的雏形，而尚书台下设六曹尚书，是后来“三省六部制”的雏形。