功曹参军是古代军事行政僚属官职，其渊源可追溯至秦汉时期的参谋军务人员。晋代发展为诸王及将军幕僚职位，陶渊明、范晔等人均有担任参军经历。隋唐时期正式转化为地方行政官职体系，杜甫曾任华州司功曹参军，白居易曾任京兆府户曹参军，其职能从军事参谋扩展至地方人事考核、文书处理等行政事务。

参军制度起源于汉末丞相府军事幕僚建制，《出师表》记载的参军蒋琬刘义康参军等案例，表明其已发展为固定幕僚职位。

隋代官制改革中将参军系统纳入地方行政体系，唐代继续完善该制度。杜甫在安史之乱后（757年）担任华州司功曹参军，白居易于806年任京兆府户曹参军，印证了该官职在唐代地方行政中的实际运作。

在节度使属官架构中，功曹参军与行军参军同属地方军事行政僚属序列。其具体职责包含：

《新唐书·职官志》记载，该职位设有固定品阶与俸禄，标志着由临时幕职向正式官职的转型。唐代中期后，部分功曹参军还兼领屯田、水利等专项事务。

该官职在五代后逐步被新的地方僚属体系取代，但其制度遗产影响了宋元时期的幕职官体系构建。