防卫医科大学是日本防卫省直属的军事医学院校，1973年11月成立于埼玉县所泽市，以培养自卫队军医与护理人员为核心职能。学制6年，设医学科与看护学科，实行全额津贴制度，学生需履行毕业后至少9年服役义务，中途离职须返还培养经费。教学内容涵盖医学课程与自卫官军事训练，毕业生需通过国家医师考试并完成干部候补生学校培训方可任职。

学校直属防卫省。该校下设事务局、医学教育部、医院、图书馆和防卫医学研究中心等机构。

防卫医科大学，学制6年，每年招收学员80名，总定员480名。

防卫医科大学校于1973年设立，1975年设立高等护理学院，1977年设立防卫医科大学校医院，1987年设立大学院医科研究科，1996年设立防卫医学研究中心。相关机构包括防卫医科大学校医院、防卫医学研究中心和高等护理学院。

防卫医科大学教学内容大致分为医学教育课程和训练课程两大类。(一)医学教育课程，依学校教育法，按地方医科大学标准设置分基础课程和专业课程。(1)基础课程，包括一般教育、外语、保健体育和基础教育，在第1、2学年学完，结业时需获86个学分。 (2)专业课程，第2学年到第6学年学习，总学时为4758个学时。其中基础医学课程2136小时，学习内容有解剖学、生理学、生化学、药理学、病理学、细菌学、卫生学、公共卫生学、寄生虫学、法医学、医用电子工程学；临床医学课程2512小时，学习内容有内科学、精神科学、小儿科学、外科学、脑外科学、整形外科学、皮肤科学、泌尿科学、眼科学、耳鼻喉科学、妇产科学、放射线科学、麻醉学。此外，还有特别讲座110小时。(二)训练课程，包括基础教育 (徒步教练、体育、游泳、滑雪、教育法)和部队实习，共计507个小时，第1学年为96个小时，第2个学年为156个小时，第3学年为 94个小时，第4学年至第6学年为93个小时。训练课程的目的在于培养军官所需要的基本素质和技能。

学员毕业后，被授予士长军衔，到自卫队训练部门接受6周军官必修课训练。另外，学员经国家医师考试合格者，可获得医师证书，授二尉（中尉）军衔。获取医师证书者，按照医师法在防卫医科大学医院或自卫队中央医院进行研修两年，研修结束后，分配到陆、海、空自卫队医院或其他医疗设施任军医，从事医疗卫生工作。防卫医科大学毕业的学员，必须在部队服役9年，根据自卫队规定，未满9年要求退役者，须偿还一定的赔偿金。

防卫医科大学校医学科学生的招生对象为18岁以上21岁未满者，包括高中毕业生或高等专门学校3年次修了者。考试科目包括一次学力試験及小論文試験、二次口述試験及身体検査。考试日程为一次在令和7年10月25日举行、二次在令和7年12月17日至19日间的指定日期举行。合格発表一次在令和7年12月2日、最终在令和8年1月30日。入校时期为令和8年4月上旬。学生每月可获得151,300円手当（令和7年1月1日现在），并有年2回的赏与。费用无入学金和授業料。毕业后需在自衛隊服役9年，中途离职需偿还培养费用，例如令和5年3月毕业生最高偿还额为4,363万円。

防卫医科大学还设有研究生科。研究生科系列分为： (1)综合基础医学群，其中包括综合生理学学科系列、综合病理学学科系列、综合社会与环境医学学科系列。(2)综合临床医学群，其中包括急救医学学科系列、成人医学学科系列等5个学科系列，共计34个专业。研究生科的招生对象主要是防卫医科大学、一般大学的医学部、牙学部和兽医学部毕业后工作4年以上的人员。第1期招生12人，均为防卫医科大学毕业生。应试者必须有所在单位的长官，即官房长官、各设施机关的长官，陆上、海上、航空自卫队参谋长、参谋长联席会议事务局长、技术研究本部部长、设施厅长官的推荐。考试内容有两项：外语(英语、德语或英语、法语)和志愿选修单位的口试。学制4年，第1、2学年学习选修专业，第3、4学年接受撰写论文的有关指导。成绩优异者，学习期限可减为3年。

1996年10月，日本自卫队又在防卫大学内设立了防卫医学研究中心，并为列为该校的建制单位。该中心是专门从事军事医学人造血液研究，该研究模拟生物血液的储存和运输氧气功能，用于手术或创伤后严重失血情况，在偏远地区挽救生命。异常环境卫生部和行为科学部还要配备具有灾害现场医疗经验的医官。