长江流域规划办公室（简称长办）成立于1956年，首任主任为林一山。其以原长江水利委员会为基础组建，作为水利部派出机构，主要承担水资源保护、防洪抗旱及重大工程协调等工作。该机构在周恩来指导下于1958年制定《长江流域综合利用规划要点报告》，确立“统一规划、全面发展、适当分工、分期进行”的规划原则。

完成了大量的规划设计工作，主要有：长江流域综合利用规划要点、三峡水利枢纽初步设计等前期工作。长江主要支流规划和丹江口、隔河岩、彭水等大型水库的规划设计，并完成了葛洲坝水利枢纽工程的设计工作。

1921年12月，成立扬子江水道讨论会。

1928年5月，改组扬子江水道讨论会为扬子江水道整理委员会。

1935年4月，合并改组扬子江水道整理委员会、太湖流域水利委员会、湘鄂湖江水文站为扬子江水利委员会。

1947年6月，扬子江水利委员会改名为长江水利工程总局。

1949年12月，开始组建长江水利委员会。

1950年2月，长江水利委员会成立。

1953年2月，毛泽东同志听取长江委主任林一山关于治理长江问题的汇报。

1956年，以长江水利委员会为基础，成立长江流域规划办公室。

1980年7月，邓小平同志听取葛洲坝工程进展情况汇报。

1988年，长江流域规划办公室改名为长江水利委员会，为水利部派出机构。