长官司是元代在西南边疆少数民族地区推行的地方政权机构，属土司制度的重要组成部分。该机构以世袭土官为主体，于至元年间平定西南后普遍设立，典型如乌罗龙干等处长官司（1283年）、都云军民府（1285年）等。机构设达鲁花赤、长官、副长官，统属于思州军民安抚司或八番顺元宣慰司，主要负责维持边疆税收、司法与防务。

元代在至元十五年（1278年）实施军事管控后，逐步将西南各洞寨改制为长官司，至元二十年（1283年）乌罗地区率先完成行政建制。至元二十二年至二十九年（1285-1292年），在都匀地区密集设立都云军民府、都云安云安抚司等机构。该制度延续至元末，明代初期仍部分保留元代旧制，如洪武十六年（1383年）设立的都匀长官司仍沿用土官体系。

长官司设达鲁花赤（蒙古监政官）一员，正五品；长官（土官）一员，从五品；副长官（土官）一员，正六品。重大事务需呈报上级宣慰司核准，日常民政则由土官自主处理。以乌罗龙干等处长官司为例，其管辖范围涵盖今贵州松桃县全境及周边三县交界地带。

。都匀地区在至元年间设立的多个长官司，均保持原住民社会组织结构不变，仅通过土官进行间接管理。

乌罗长官司的改制具有代表性：至元十五年（1278年）设乌罗洞进行军事管制，至元二十年（1283年）正式改置为乌罗龙干等处长官司，隶属思州军民安抚司。都匀地区则在至元二十二年（1285年）设立都云军民府，后于至元二十九年（1292年）增设抚定光兰州洞蛮定远府，形成密集的长官司网络。

该制度确立的土司世袭体系持续影响明清两代，明代初年改置的60余处长官司中，超过三分之一直接承袭元代旧制。但元代严格限定土司的武装规模和司法权限，相较于后世土司，其自治权相对受限。机构档案现存《元史·地理志》等文献记载，乌罗、都匀等案例成为研究元代边疆治理的重要实证。