郑州大学神经科学研究院成立于2018年5月，是郑州大学批准成立、依托第三附属医院建设的学术机构，聘任复旦大学杨雄里院士担任名誉院长。研究院以神经科学与行为学为主要研究方向，2025年1月该学科ESI全球排名达到3.35‰。拥有5000平方米科研场地，配备总价值超5000万元的4.7T小动物核磁成像系统等高端设备。截至2025年，已形成涵盖分子、蛋白、组织等6类实验室及SPF动物房的综合研究平台，在新生儿脑损伤防治、神经信息处理等领域取得多项科研成果。

2018年5月经郑州大学批准成立，首期建设期间（2018-2021年）获郑州大学与三附院对等投入8000万元。2020年3月，神经科学与行为学学科成为郑州大学第8个进入ESI全球前1%的学科，2023年3月排名提升至4.92‰。

研究方向包括：

建有6类实验室：

2023年承办郑州大学研究生国际暑期学校医学分校，吸引近400名师生参与。截至2024年，已招收博士后及研究生数十名，组建含5名博导的科研团队。

与复旦大学脑科学研究院共建神经性视觉损伤实验室，同瑞典哥德堡大学等开展国际合作。2025年举办专家研讨会，杨雄里院士等参与学科发展规划研讨。