遍知院是
密教胎藏界曼荼罗体系中的核心组成部分，在日本东密（真言宗）体系中归属于
中台八叶院外围部院。该院以
准提佛母（
七俱胝佛母）为核心尊神，作为莲华部诸尊的母体，承担赋予部众功德的功能。其院内配置包括
佛眼佛母、
大勇猛菩萨、如来商佉菩萨等16位核心尊格，尊形特征与种子字系统均体现密教三密修行体系。
遍知院在胎藏界曼荼罗中有两种结构划分方式：四重圆坛体系中，或作为环绕中台八叶院的第一重四院之一，与莲华部院并列；或在中台列为第一重时，归属第二重六院系统。十三大院分类中，该院位列第七尊，与观音院、金刚手院共同构成胎藏界仪轨核心。