选择性剪接是基因表达调控的核心机制，通过不同外显子组合产生多样化的mRNA及蛋白质异构体。该机制在肿瘤中可生成特异性新生抗原并调控代谢重编程，例如PKM2异构体通过增强糖酵解促进瓦博格效应。植物领域研究发现COP1蛋白与UAP56协同调控光响应基因的可变剪接，揭示该机制在环境信号转导中的普适性。目前基于CRISPR的人工剪接因子技术已进入肿瘤治疗探索阶段。

通过选择性排除特定外显子或保留内含子改变mRNA结构，使单个基因产生多个蛋白质异构体。剪接体动态组装过程中，RNA结合蛋白与顺式作用元件协同决定剪接位点选择。

中国科学院植物研究所2022年研究发现，COP1与UAP56形成复合体调控光形态建成：