连锁群是遗传学中描述染色体上基因座位线性排列的核心概念，其定义源自摩尔根通过果蝇实验建立的染色体遗传理论。通过三点测验法、重组值测定等方法，可将基因座位精确定位到连锁群形成遗传图谱。在真菌、家蚕等物种研究中，连锁群构建技术支撑了基因组组装与重要农艺性状基因定位。人类基因组研究中，23条连锁群对应单倍体

连锁群指同一染色体上按线性顺序分布的基因座位集合，其数目等于物种单倍体染色体数目。1905年贝特森在香豌豆杂交实验中首次观察到性状连锁现象，但未能解释其机制。摩尔根团队通过果蝇眼色（红眼/紫眼）与翅型（长翅/残翅）的遗传规律研究，于1911年提出基因在染色体线性排列理论，建立连锁群概念。斯特恩通过果蝇X染色体基因（ec、sc、cv）的三点测交实验，验证了基因座位空间排列与重组率的对应关系。

连锁群内基因座位遵循连锁与互换规律：

重组值计算采用测交法（重组型配子比率）和三点测交法（双交换校正）。遗传距离单位厘摩（cM）定义为1%重组率对应的物理距离，人类基因组总遗传距离约3300cM。

连锁群构建流程包含四个阶段：

在杏鲍菇遗传图谱构建中（2018年研究），通过178个子代基因型数据分析，最终形成12条连锁群，总图距1047.9cM，定位多个农艺性状相关QTL位点。

2025年研究通过二重星纹表型与连锁群标识性状的杂交组合，将Dus基因定位于第10连锁群3.9cM处，验证基因线性排列规律。1985年家蚕血液酸性磷酸酶基因（Bph）研究中，通过连锁分析将其归属于特定连锁群，建立共显性复等位基因的座位分布模型。

冠腐病菌遗传图谱构建（2018年）通过898cM总图距的4条连锁群，将57个scaffold锚定到染色体，发现与禾谷镰刀菌致病结构域的共线性关系。该案例显示连锁群分析可提升基因组组装质量，并为比较基因组学研究提供基础。

牛乳蛋白基因研究中（2024年），K-酪蛋白基因与乳脂率、αs1-酪蛋白基因与产奶量均呈现显著连锁关系，为标记辅助选择提供理论依据。此类研究通过连锁群分析确定经济性状相关基因座位的染色体位置，加速畜禽遗传改良进程。