软件工程国家工程研究中心成立于1996年7月，是经国家计委和教育部批准、北京大学承建的国家级科研机构。首任主任由中国科学院院士杨芙清教授担任，现任主任为张世琨研究员。中心以软件工程开发环境、软件产品测试维护、标准规范制定等为主要任务，依托“青鸟工程”攻关项目，研发了自主知识产权的软件工程化工具及产品。其静态代码分析工具库博（CoBOT）于2018年获日内瓦国际发明展金奖，并助力中小微企业数字化转型。截至2025年，中心承担国家级项目50余项，参与制定国内外标准20余项。

1996年7月，国家计委和教育部批准成立软件工程国家工程研究中心，由北京大学承建，杨芙清院士担任首任主任。2000年12月，中心建立成果转化基地，加快产业化步伐。2011年，成为北京大学软件工程一级学科牵头单位。2020年，发起“数字化转型伙伴行动”倡议，提供工具支持中小微企业。

中心主要研究领域包括软件工程、软件与系统安全、大数据分析、自然语言处理。下设知识计算、智能计算与感知、大数据技术三个实验室，致力于信息抽取、机器学习等领域。

研发静态代码分析工具库博（CoBOT），2018年获日内瓦发明展金奖及阿里大赛冠军。参与制定软件行业技术标准、信息安全标准。承担国家科技攻关、863项目等20余项。截至2025年，承担国家级项目50余项，参与制定国内外标准20余项。

提供“库博”系列工具提升中小微软件质量，推出“数博”工具降低数字化转型成本。开展技术咨询、人才培养，合作覆盖航空、航天等领域。

中心牵头北京大学软件工程一级学科建设，年招生博士30人、硕士240人。2018年承建“青少年人工智能技术水平测试”题库，开展科技创新人才贯通式培养。