财政缺口指政府财政收入与支出之间的不平衡状态，主要表现为横向缺口和纵向缺口两种形式。横向财政缺口源于同级政府间财政收入能力差异导致的收支失衡，纵向财政缺口由上下级政府间事权与财权划分不对等引发。
横向财政缺口表现为同级政府间因经济差异导致的收支不平衡，常通过横向转移支付实现资金调剂。纵向财政缺口源自政府层级间支出责任与收入能力不匹配，中央政府集中主要税源但承担较少支出责任，地方政府则相反。
1994年分税制改革确立了中央与地方的收入划分框架，但未同步调整事权划分，导致地方政府承担超过60%的财政支出责任却仅获得约45%的财政收入。这种收支倒挂使地方财政自给率持续下降，截至2025年仍存在显著纵向失衡。
河南省滑县作为全国小麦产量第一大县，每年获得的中央专项资金与邻近低产县相当，暴露出转移支付制度中粮食贡献与资金补偿不匹配的问题
中央通过政府间转移支付调节财政缺口。前者用于平衡地区间基本公共服务能力，后者针对特定政策目标实施。但现行制度仍存在资金分配与实际贡献不匹配现象，如对农业大县的补偿力度与其粮食产量不成正比。