西博寮海峡位于香港南丫岛西岸与坪洲、喜灵洲、长洲东岸之间，呈南北走向，长约4海里，宽3.2至4海里，水深7至15米。该海峡是连接南海与珠江流域的重要水道，实行分道通航制管理，主要供港澳快速客船及万吨级以下船舶使用。驻香港部队舰艇大队长期在此开展实战化训练，验证了其作为军事训练场地的战略价值第四纪沉积物研究表明该区域全新世时期具有潮间带与浅海交替的生态环境特征。

西博寮海峡南北走向连接维多利亚港与南海，北部水域宽度仅3.2海里且水深较浅（7-10米），南部扩展至4海里宽且水深增至15米。涨潮时形成西北向水流，流速可达3节，落潮转为东南流，航道中央无障碍物但需注意长洲西北侧0.7链范围内的干出礁。1997年钻孔研究显示该区域第四纪沉积层厚约40米，全新世沉积物中硅藻群落以潮间带物种为主，反映全新世早期海平面上升过程。

狭水道航行、岛礁区机动等实战化训练，验证了该海域通航密度大、水文条件复杂的特点。训练记录显示海峡中部水域在季风期常出现超过3米浪高，舰艇横摇角可达15度以上。驻港部队将此处作为常态化训练场，主要开展编队战术协同、应急机动等科目演练。

西部水域设有分道通航制，入口位于大屿山分流角，经石鼓洲分岔为内外航道：外航道供快速客船使用，内航道服务常规货轮。航道配备满台岛南角呢灯塔（北纬22°11′）、黄麻角灯塔（北纬22°12′）及深水排灯桩（北纬22°12.5′）三处导航设施。根据2021年数据，东博寮海峡实施的15节航速限制同样适用于该区域相邻航道。

2010年规划方案拟在西博寮海峡西岸（大屿山东部）填海90平方公里，建设连接芝麻湾半岛至交椅洲珠三角西部经济联系。

2025年民航数据显示，夜间23:00至07:00时段使用香港国际机场07跑道离港的航班中，约78.4%的南行航线经过西博寮海峡空域。民航处通过实时监测确保飞行高度与航道偏移量符合安全标准。

第四纪硅藻研究显示该海域存在186种硅藻，其中Cyclotella striata（条纹小环藻）在更新世沉积层占比达37%，表明冰期低海平面时的河口环境。Holocene层位Thalassionema nitzschioides（菱形海线藻）含量激增至42%，印证中全新世最大海侵事件。现代水文监测显示海峡东部近南丫岛水域存在季节性赤潮现象，主要藻种为夜光藻和骨条藻。