菌根菌是土壤真菌与陆生植物根系形成的互惠共生体。1885年由德国学者Frank首次发现并命名，目前已发现外生菌根、丛枝菌根等7种类型。其共生关系表现为真菌协助植物吸收水分和矿质元素，植物则为真菌提供碳水化合物。全球约90%高等植物具有菌根联合体，在森林、草原等生态系统中承担着扩大养分吸收范围、改善土壤结构、增强植物抗逆性等重要功能。中国自20世纪70年代开展研究，已建立包含136株丛枝菌根真菌的种质资源库，应用于造林工程、盐碱地修复及农业生产等领域。

菌根。截至2021年研究显示，该共生体系覆盖90%陆生植物，成为陆地生态系统的基础组成部分。

根据共生结构差异分为三大类型：

菌丝网络通过分泌球囊霉素促进土壤团聚体形成，单克菌丝可增加土壤持水量。2021年研究证明，菌根植物根系吸收面积较普通植物扩大1600倍。

菌根联合体通过多重机制提升抗逆性：

2021年昆明植物所研究发现，菌根菌丝可侵入非宿主植物（如十字花科）根系，通过分泌挥发性萜类抑制其生长，维持宿主植物竞争优势。青藏高原高寒草地的观察显示，菌根网络能协调不同物种的养分分配，降低群落竞争强度。

菌根化育苗技术使杨树造林成活率提升27%，玉米籽粒含磷量增加35%。2024年白及组培试验显示，接种枝孢菌MF-1菌株可使叶绿素含量提升43.67%，净光合速率提高56.65%。

捷克诺曼公司开发的复合菌根菌剂适应多种土壤环境，在山东盐碱地试验区促进植被恢复。矿区复垦中，菌根化红毛草对铅、锌的富集系数分别达1.82和2.15。

北京市农林科学院资环所建立的BGC菌种库，截至2024年保藏有5属25种丛枝菌根真菌，开发出抗根结线虫菌剂Gm18，防治效果达68.3%。国际菌根真菌种质库（INVAM）则保存着2000余株菌株资源。

2021年研究发现，菌根菌丝能穿透非宿主植物根系诱导系统抗性，但会抑制其根分支数42%-57%。2024年白及菌根共生机制解析显示，Cladosporium sp.菌株通过促进可溶性糖积累（增幅82.01%）和假鳞茎分化实现促生效果。捷克与中国合作研发的第五代菌根菌剂，在极端土壤环境中保持高侵染活性。