萧药师奴，辽代契丹族人物，梁王萧术哲之侄，官至安东军节度使。

萧药师奴是萧朮哲之侄，幼年即聪颖有悟性，谨守礼法，补为祗候郎君。大康年间，担任兴圣宫使，累迁为同知殿前点检司事。道宗赞赏他主持宿卫严谨认真，迁为右夷离毕。夏王李乾顺被宋攻打，寻求和解，道宗命药师奴持节出使宋朝，请求罢兵通好，宋听从了。拜为南面林牙，改任汉人行宫副部署。

乾统初年，外放为安东军节度使，后去世。