苏州工业园综合保税区于2006年12月17日经国务院批准设立，规划面积5.28平方公里，由东区（3.88平方公里）、西区（1.4平方公里）组成，2007年8月28日通过海关总署等九部委联合验收封关运作，成为全国首个综合保税区。该区整合原陆路口岸通关点、出口加工区及保税物流中心(B型)功能，执行“国外货物入区保税、国内货物入区退税”政策，是全国唯一兼具“自贸区+综保区+贸易多元化试点+一般纳税人资格试点”功能的海关特殊监管区域，作为苏州自贸片区的重要功能平台和唯一的海关特殊监管区域，拥有保税物流、国际中转、智慧物流平台等业务，配套沪宁高速直连通道、苏州园区港河海联运等交通设施。

1997年8月，苏州工业园区唯亭海关监管点成立，成为全国首批三家直通式陆路口岸之一。2000年4月，园区成立了出口加工区A区，同年，苏州工业园区获批成为全国首批出口加工区的试点之一。2002年，苏州工业园区试行“SZV快速通关模式”，将上海的国际机场延伸到了苏州，大大缩短了物流时间，使园区拥有了“虚拟空港”。2007年苏州工业园区开始实行SZV返程，以“空陆联程”和“陆空联运”两种模式为企业服务。苏州工业园区还与太仓港、洋山港进行区港联动，形成了“虚拟海港”。“虚拟空港”和“虚拟海港”的创新彻底解决了园区没有实体海空港的问题。

2004年，海关总署先后批准在园区设立出口加工区B区和进行全国首家“海关保税物流中心（B型）”试点，海关保税物流中心（B型）的监管模式解决了加工贸易产业链上下游全国间的产品流转问题，结束了相邻企业产品必须“香港一日游”的局面。同时，也为园区物流业开展VMI（供应商管理库存模式）和DC（进出口分销模式）提供了可能。目前，园区保税物流的业务辐射全国23个省市，服务于区内外2000多家生产企业。

2006年12月17日，国务院正式批准同意在苏州工业园区设立“综合保税区”，开展具有保税港区综合保税功能的海关特殊监管区域试点，这是中国内陆首个没有港口的保税港区。

2007年8月28日，苏州工业园综合保税区通过了海关总署等国家九部委的联合验收并封关运作。根据国务院批复，苏州工业园综合保税区“有关税收、外汇政策将按照《国务院关于设立洋山保税港区的批复》的有关规定执行。海关比照保税港区的监管办法对其实施监管”。这意味着综合保税区除享受“国外货物入区保税、国内货物入区退税”的政策外，还适用各项保税港区的优惠政策，可以充分发挥区位和政策优势，拓展相关功能。目前，综合保税区内可以从事的业务包括：存储进出口货物和其他未办结海关手续的货物；对外贸易，包括国际转口贸易；国际采购、分销和配送；国际中转；检测和售后服务维修；商品展示；研发、加工、制造；港口作业；经海关批准的其他业务。

2014年9月，国务院同意苏州工业园综合保税区开展贸易多元化试点。2016年11月，苏州工业园综合保税区成为全国首批增值税一般纳税人资格试点区域。2019年，中国（江苏）自由贸易试验区设立，苏州工业园综合保税区被纳入苏州片区范围。2021年，在全国综合保税区发展绩效评估中，苏州工业园综合保税区综合排名跃居全国第七。

2025年4月7日，中国首个跨省市、跨关区前置货站“上海机场-苏州前置货站”正式启用。2023年，在海关总署全国综合保税区发展绩效评估中，园区综保区位列全国第九（东部地区第七）。2024年，园区综保区在离岸租赁、进口药品通关一体化等方面取得新突破。2026年1月1日，苏州工业园综合保税区西区行政通道智慧管理系统上线试运行。

苏州工业园综合保税区(西区)-停车场位于苏虹中路200号。江苏自贸区苏州片区面积为60.15平方公里，其中包含苏州工业园综合保税区5.28平方公里。该综保区规划面积5.28平方公里，分为口岸作业区、仓储物流区和保税加工区三个功能区域，实行围网监管。

周边公交站包括园区综保西区、园区综保西区南、白塘路西、白塘景苑等，提供多条公交线路。

苏州工业园综合保税区位于中国（江苏）自由贸易试验区苏州片区内，该片区实施范围60.15平方公里，其中包含苏州工业园综合保税区5.28平方公里。

苏州工业园综合保税区已初步形成装备制造、电子信息、医疗器械、航空零部件四大类高端制造产业集群，以及内外贸物流、货物贸易和离岸贸易产业集群，不断完善“保税+”新业态布局。

2022年，苏州工业园综合保税区实现进出口2023亿元，同比增长1.4%，占苏州工业园区外贸总值的28.3%。在海关总署的全国综合保税区发展绩效评估中，2023年度园区综保区综合排名第9名（东部地区第7名）。区内一般纳税人资格试点企业累计备案已突破37家，试点数量居南京关区第一、全国前列。

2026年1月1日，苏州工业园综合保税区西区行政通道智慧管理系统上线试运行，旨在优化行政通道车辆管理、规范内部停车秩序。此外，为支持生物医药及大健康产业发展，园区支持符合条件的全球领先食品、保健品在综保区内从事分包装业务，并通过跨境电商模式进入国内市场。

2023年，园区围绕推动监管措施优化、保税功能业态拓展等，举办23条综合改革措施宣讲会，并推动部分措施率先落地。

苏州工业园综合保税区经过五年多的发展，各类基础设施及基建投入已超过60亿元，建成保税仓库40万平方米，厂房100万平方米，区外周边建成普通仓库80万平方米，商业办公设施50万平方米，已经初步形成设施先进、配套完善、交通便利，集保税加工、保税物流和进出口贸易为一体的大型综合性功能区域。

今后，苏州工业园综合保税区还将继续发挥“先行先试，不特有特”的政策优势，在综保区的建设发展上继续保持前进的势头，为园区和苏州的进一步发展创造新的增长点，甚至在全国形成示范效应。

苏州综保大厦位于苏州工业园综合保税区海关卡口旁，是一站式服务办公建筑。该大厦为海关、国检、国税、外管等部门提供一站式办证大厅。大厦食堂配备智慧餐台、智能保温台等智能化设备以满足员工就餐需求。

苏州工业园综合保税区建立了信息化监控监管体系，包括总长26公里的电子隔离围网、4个监管卡口、3个监控中心以及16道全自动型RFID卡口管理系统。该体系实现全天候监控和自动化通关。苏州工业园综合保税区西区行政通道智慧管理系统于2026年1月1日上线试运行，覆盖西区所有行政通道。该系统旨在优化行政通道车辆管理、规范内部停车秩序。

苏州工业园综合保税区（西区）周边设有多个公交站点，包括园区综保西区站（158路）、园区综保西区南站（108路、126路等）。人员可通过这些站点往来。