结晶轴（crystallographic axis）是结晶学中用于描述晶体结构的人为坐标轴，与晶胞参数a、b、c方向平行，构成右手坐标系，用于定义晶面、晶向和原子坐标。其为假想直线，贯穿理想晶体中心，通常选择对称轴或对称面法线方向，并优先保证轴间垂直性和轴单位一致性。

晶体中的坐标轴称为结晶轴，简称晶轴。晶轴是几条假想的直线，沿着与晶体对称有关的限定方向穿过理想晶体，相交在晶体中心。

(1)晶轴的选择要符合晶体自身的对称性。因此，要优先选择对称轴作为晶轴；对称轴不够或没有时，选对称面的法线方向作为晶轴；对称面数目不够或没有时，选择合适的晶棱方向作为晶轴。在选择晶棱做晶轴时，可以设想将其平行移动至晶体中心。

(2)在满足上述条件的前提下，应尽可能使晶轴互相垂直或近于垂直，并使轴单位尽可能相等，即使a=b=c，α=β=γ=90。

除三方晶系、六方晶系以外的晶体，均采用X、Y、Z三轴定向。X、Y、Z晶轴的安置是：Z轴直立，上端为正；X轴前后，前端为正；Y轴左右，右端为正。轴角：X、Y、Z晶轴正端之间的夹角为轴角。

三方、六方晶系的晶体采用X、Y、U、Z四轴定向。4根晶轴的安置是：Z轴为直立轴，上端为正。X、Y、U为3个水平轴，Y轴左右，右端为正：X轴为左前，前端为正；U轴右前，后端为正。水平晶轴X、Y、U正端之间的夹角为120°。