穆罕默德三世（Mehmed III，1566年5月26日－1603年12月22日），
奥斯曼帝国第十三位苏丹，第七十二任伊斯兰哈里发，
穆拉德三世之子。1595年继承王位后，成为最后一位先任地方总督再即位的皇子，登基时奥斯曼帝国正与
奥地利进行长期战争。
穆罕默德登位时将十六个弟弟处以绞刑，所以他在奥斯曼帝国的历史上当代仍然恶名昭彰。他是一个懒散的苏丹，把政府交给母亲皇太后Safiye Sultan管理。他任内最重大的事件是在1596年至1605年在
匈牙利发生的奥地利—奥斯曼帝国战争。
穆罕默德的军队在1596年占领了匈牙利境内的
埃格尔，并在Mezokeresztes战役（
克雷斯茨战役）中打败
哈布斯堡王朝和川西凡尼亚的军队，但穆罕默德本人在战役中途却曾打算逃离战场，不过被劝阻。