科技计划管理改革是2015年由科技部、财政部共同起草的《关于深化中央财政科技计划（专项、基金等）管理改革的方案》的核心举措，旨在解决科技资源配置分散重复、多头管理等问题。该方案要求整合原973计划、863计划等形成国家自然科学基金、科技重大专项等五类科技计划，明确政府部门不再直接管理具体项目，委托专业机构承担项目评审与验收工作。

中国国务院2015年1月印发的《关于深化中央财政科技计划（专项、基金等）管理改革的方案》指出，由于顶层设计、统筹协调、分类资助方式不够完善，现有科技计划（专项、基金等）存在着重复、分散、封闭、低效等现象，多头申报项目、资源配置“碎片化”等问题突出。《方案》提出，优化布局，整合形成五类科技计划（专项、基金等）。此外，政府不再直接管理科技项目。

科研经费乱象久被诟病。科研领域存在着不同程度、不同级别的腐败。科研经费分配新办法将各类科技项目整合优化为五类，把政府部门从项目的日常管理和资金的具体分配中解放出来，杜绝科研领域“九龙治水”和庞杂体系带来的弊端。