deuterium exchange method
化学术语
氘交换法(deuterium exchange method)是化学中用于检测
蛋白质
动态折叠特性的分析方法。该方法通过监测蛋白质骨架质子与
重水
中氘的交换反应,揭示其结构特征,尤其适用于
α-螺旋
构象分析。
简介
是指
离子交换法
一般用于
蛋白质结构
检测 一般用于测α-螺旋
H/D Exchange Method
Pulsed-Amide H/D Exchange Method
1.Pulsed-Amide H/D Exchange Method
蛋白质骨架上面的质子在未被保护的情况下(暴露在溶剂环境中,不受自身其他氧、氮原子中的孤对电子的影响)会与重水中的氘发生质子交换。
>N-H + D2O f>N-H + DOH
蛋白处在开折叠得状态时,发生氕氘交换,之后检测蛋白重新折叠起来的动力学过程。
对于大多数蛋白而言,两端的helices骨架上的60%质子在前20ms的时间内形成折叠,而剩下的40%的质子在接下来的100ms和10s内形成折叠。
实验过程
(A)在蛋白样品中加入变性剂,使得蛋白处在开折叠的状态下,并且使得蛋白中的全部质子交换成氘pD6.0(时间需要3s以上);
(B)在上述的样品中加入H2O(pH6.0可以是酸性溶剂),稀释变性剂浓度,使得蛋白样品开始重新折叠。
(C)加入H2O碱性溶剂pH 9.0,此时质子交换时间在1ms以内。
(D)当蛋白重新折叠完之后,用NMR或者MS检测蛋白结构
参考资料
药物分子氘代修饰方法研究进展
.中国生物医学文献服务系统.2025-02-20
Deuterium substitution at the intolerable site as a strategy to mitigate the toxicity of camptothecin derivatives
.上海科技大学.2025-07-17
最新修订时间:2025-11-06 16:04
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