《名侦探柯南͏ 瞳孔中的暗杀者》是《名侦探柯南》第4部动画电影作品，由
儿玉兼嗣执导，于2000年4月22日在日本上映，同年8月26日在中国台湾地区上映。影片以
多罗碧加乐园为舞台，讲述了在警察凶杀案不断发生的情况下，小兰因在案件现场遭受精神冲击而失忆，且因目击了犯人的脸而被盯上了性命的故事。漫画原著第1卷、电视动画片第1集中描绘的新一和小兰在多罗碧加乐园的约会场景也有出现。
发生了以警察为目标的连续杀人案。目睹了现场的柯南，拼命追踪却扑了个空，让犯人逃跑了。而且，在询问案件的时候，白鸟刑警还说出“Need not to know（无需知道）”。就在这时，佐藤刑警在警方相关人员聚集的聚会上被袭击，刚好在场的小兰因精神打击而丧失了记忆！因为目击了犯人的脸，小兰的性命被盯上了。柯南能守护忘记一切的小兰吗？
剧本阶段，导演儿玉兼嗣、编剧古内一成和助理制片人三个人去了首都圈的几个游乐园。在剧本完善的阶段，古内提出了配合故事展开的多罗碧加乐园总体示意图。美术设定是以该示意图为基础制作的，但是在创作游玩设备和建筑物等的细节，以及进行游乐设施的设计时，制作团队决定进行正式的实地取材。
在制作电影时，美术指导和背景制作人员花了三天两夜彻底地考察了
志摩西班牙村。影片开头的过山车等场景就是直接参考了该游乐园内的游乐设施而设计的。园内自由取材期间，他们使用免费通行证体验了载具和游乐设施。柯南用滑板跳跃的“冰与雾的迷宫”和柯南告白的场景的“熔岩流”，还有“喷泉广场”等，是由美术指导涩谷幸弘基于剧本原创的。仅多罗碧加乐园的美术设定就达到了全体的1/3。富士急乐园是片尾字幕背景的实拍视频拍摄地。白鸟的妹妹所前往的举行聚会的酒店，则是以
中野太阳广场酒店为原型。酒店的女接待员的制服，被用作寄存处服务员制服的参考。小兰所住医院的取材地点为日本大学医学部附属板桥医院，除通道和大厅外，还参考了
磁共振成像设备。
片中也存在“恶搞场景”，譬如聚会接待账本上的名字中出现了影片制作人员的名字。而妃英理的签名，其实是助理制片人写的。聚会会场的爆炸场景中犯人使用的手机号码，是助理制片人的手机号码。报纸上“芝刑警遇害”的报道，也是助理制片人想的。多罗碧加乐园的场景中，曾协助取材的志摩西班牙村营业部工作人员中野、中二人作为嘉宾出演。
日本当地时间2001年4月2日19时、2007年10月8日19时，影片在读卖电视台、
日本电视台《
名侦探柯南》版块播出。当地时间2020年1月10日18时40分至20日10时，日本电视台联播网《周五路演！》节目官方网站在特别设置的页面举行投票，1人仅能投1次；活动总票数为510144，其中《名侦探柯南 瞳孔中的暗杀者》获77991票，列第1位，于当地时间2020年2月7日21时在同一节目中播出，收视率10.3%。影片还在WOWOW Prime、WOWOW Cinema于2017年5月5日起播放的特别节目中播出（该特别节目将《名侦探柯南 计时引爆摩天楼》直至《
名侦探柯南：纯黑的噩梦》依公映顺序播放）。2024年5月14日、18日，影片分别在WOWOW Prime和WOWOW Cinema播出（WOWOW Ondemand同步直播）。
《名侦探柯南 纯黑的噩梦》上映期间，用户可通过作为入场观众获赠的卡片“来自青山刚昌的纯黑的感谢信”上附带的序列号在特别设立的网站免费收看《名侦探柯南》系列电影前19部作品中任意一部。
大陆地区由
上海新创华文化发展有限公司代理，授权
PP视频（已下线）、
爱奇艺、
优酷网、
腾讯视频、
哔哩哔哩上线。哔哩哔哩对该片的汉语配音版本完成了4K超清修复。
台湾地区电视播放平台包括
momo亲子台等；流媒体平台包括Hami Video和MyVideo。