环境保护部科技标准司是国家环境保护部直属机关司局单位，负责环境保护科技政策规划制定、环境标准管理、技术体系建设和环境健康研究等职能，下设综合处、环境科技发展处等5个机构。其主要职责包括组织拟定环保科技政策与标准，协调国家重大环保科技专项，推动环境技术应用与产业发展，并参与气候变化应对工作。
管理环境保护科技成果。指导直属单位的科技工作。负责环境保护科技体制改革。组织建立部级重点实验室和工程技术中心。组织拟定并发布各类国家环境基准、环境保护标准、技术规范和污染防治技术政策。负责地方环境保护标准备案工作。
推动国家环境技术管理体系建设。管理环境标志认证工作。建立环境保护设施运营单位资质认可制度。指导和推动循环经济、清洁生产与环保产业发展、绿色消费和政府绿色采购等相关工作。
参与应对气候变化组织协调工作。组织管理环境与人体健康有关工作。负责
国家环境咨询委员会、部科学技术委员会日常工作。
承担司内文电、会务、机要、保密、安全、印章、档案、财务预算、固定资产管理、政务信息与公开、工作计划与总结等综合性事务和综合协调工作；承担国家环境咨询委员会和部科学技术委员会日常工作。
拟订国家环境保护科技发展政策、规划与计划；管理环境保护科研项目和科技成果；指导直属单位科技工作；承担环境保护科技体制改革工作；拟订和组织实施部级重点实验室建设规划；承担国际科技合作项目选题与立项并指导实施；承担部牵头的国家科技重大专项联络和组织管理工作。
拟订并组织实施国家环境保护标准规划、计划、管理办法；管理环境保护标准拟订工作；承担地方环境保护标准备案工作；指导地方提前实施国家机动车船污染物排放标准的审查、协调工作；归口
世贸组织技术贸易措施通报及世界车辆法规协调论坛和国际标准化组织有关专业委员会联系工作，承担国内有关环境标准专业委员会和标准技术支持单位管理、指导和协调工作。
推动国家环境保护技术管理体系建设；拟订并组织实施部级工程技术中心建设规划；管理环境标志认证工作；建立环境保护设施运营单位资质认可制度；承担环境保护重大技术工程示范工作；指导和推动循环经济、清洁生产和环保产业发展、绿色消费和政府绿色采购等工作。