玛伽山位于威海火炬高技术产业开发区北海岸，东邻哈尔滨工业大学威海校区和威海国际高尔夫球场，北临黄海海域，西接山东大学威海国际学术交流中心和威海国际海水浴场。山腰处现存三处防空洞遗迹，与周边高等教育机构、体育休闲设施共同构成区域地理特征。

玛伽山处于北纬37°31'、东经122°03'区域，形成于新生代第四纪地质运动。山体呈东西走向，平均海拔约86米，表层覆盖棕壤土质，主要植被为黑松、刺槐混交林。山腰处有三处防空洞，东面与哈尔滨工业大学和威海国际高尔夫球场邻望，北面为广阔海域，西面是山东大学威海国际学术交流中心和威海国际海水浴场。

与西侧烟墩山相距3.2公里，两山间形成的半月形海湾内发育有威海国际海水浴场，该浴场沙滩全长2800米，沙质细腻，属典型的海积地貌。山体北坡直抵潮间带，形成海蚀崖景观，崖高约12-15米，可见海蚀穴、海蚀柱等微地貌。

山腰处现存三处防空洞遗址，洞体呈东西走向，单洞长度约80米，内部拱顶结构保存完整，推测建于20世纪70年代国防建设时期。洞外现存混凝土掩体两处。

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东侧与哈尔滨工业大学威海校区和威海国际高尔夫球场邻望。西侧紧邻山东大学威海国际学术交流中心，该建筑群占地面积4.3万平方米，与玛伽山形成'山—海—校'景观体系。

。同年8月，山东大学（威海）学生团队在玛伽山社区开展肺结核防治宣传活动，发放手册400余份。

山体植被覆盖率达78%，现存维管植物127种。2025年生态监测，周边海域水质达到《海水水质标准》一类标准，潮间带生物多样性指数（BI）为3.2，属健康生态系统。

北坡海蚀崖区域设立生态保护警示牌6处，禁止游客攀爬及植被破坏行为。山体西麓建有截洪沟3条，总长度1.2公里，有效防治雨季水土流失。