烟台市海洋经济研究院是烟台市海洋发展和渔业局直属科研机构，主要承担海洋经济领域的技术研究、项目管理和产业服务工作。该院自成立以来先后荣获“烟台市先进基层党组织”、“山东海洋强省建设突出贡献奖先进集体”等荣誉称号，2024年通过发布《烟台市推动海洋经济高质量发展实施方案》助推海洋传统产业升级与新兴产业培育。在科研领域，研究院培育出刺参新品种“安源2号”，牵头建设国家级水产种质资源保护区和原种场，并持续开展市级财政预算公开工作。2024年，联合中国海洋大学编制并发布了全国首部地级市海洋发展蓝皮书《烟台市海洋发展报告》。

2025年发布全国首部地级市海洋发展蓝皮书《烟台市海洋发展报告》，该报告由中国海洋大学联合本院共同编制，于2025年在中国农业出版社正式出版，全面总结海洋强市建设成果和经验，分析面临形势任务，提出海洋高质量发展路径和主要措施。