母体遗传是通过细胞质内的遗传因子（如线粒体DNA、叶绿体DNA）而非染色体的遗传现象。其核心特征表现为正反交结果差异显著，子代性状与母本保持一致，且不遵循孟德尔遗传规律。根据遗传机制可分为细胞质遗传与迟延遗传两大类型，其中细胞质遗传直接由细胞器基因组控制，而迟延遗传则与核基因产物的胞质积累相关。植物雄性不育的质核互作型机制是该遗传现象的重要应用实例。

正反交实验结果差异是母体遗传的核心特征，源于受精过程中雌配子贡献了绝大多数细胞质成分。以被子植物为例，合子的细胞质遗传物质95%来自卵细胞，仅5%来自精子，这种不对称分配导致子代性状呈现母系优势。

母体遗传可分为两大分支：

细胞质遗传：由线粒体、叶绿体等细胞器基因组直接控制，呈现稳定的母系传递模式

迟延遗传：核基因产物在卵细胞质中的积累引发隔代表达现象，但本质上属于母性影响范畴

母性影响常被误认为母体遗传，但其实质为：

由核基因组编码的蛋白质/mRNA在卵细胞质中预先积累

仅影响子代早期发育阶段性状

经多代繁殖后最终呈现孟德尔式分离比

例如麦粉蛾（Ephestia kuehniella）的幼虫体色受母本核基因调控即为典型母性影响。

在作物育种中，质核互作型雄性不育系的应用依赖于母体遗传机制：

不育系基因型为S(rr)，其细胞质携带不育因子

保持系（N(rr)）通过杂交维持不育系特性

恢复系（N(RR)）能够恢复育性用于生产杂交种

该'三系配套'体系已在水稻、玉米等农作物中广泛应用，我国杂交水稻种植面积的98%采用此技术。

区别于核遗传的三个关键点：

连续回交不能消除母体遗传性状

不呈现等位基因分离与重组现象

显性性状表达不受隐性基因干扰

这些特性使其在进化生物学研究中具有特殊价值，例如通过线粒体DNA的单系遗传特性进行物种起源追溯。