2006年，樊建平提出“低成本健康”理念，率领团队研发出十余项获医疗认证的基层医疗检测设备及系统，实施农村医疗网底工程，截至2021年6月，已部署全国5万个基层网点，覆盖5000万人，带动销售产值、降低村卫生支出均超百亿。
据2022年12月《
集成技术》期刊官网显示，樊建平已发表论文159篇，出版专著3本。
“樊建平在高性能计算机及应用领域具有深厚研究基础，是曙光系列高性能计算机的奠基人之一。”（
中国科学院大学评）
“樊建平率领团队研发出十余项获医疗认证的基层医疗检测设备及系统，实施农村医疗网底工程，为全民健康、全面小康做出了重要贡献。”（
南开校友总会评）