有效孔隙是指岩石中可供重力水流动的连通孔隙空间，不包括结合水和气体所占据的孔隙体积。根据孔隙直径差异，超毛细管孔隙（直径大于0.5mm）因具备重力水自由流动特性被归为有效孔隙，而微毛细管孔隙由于表面张力作用无法形成有效流动通道。实验证实黏土介质的微米级颗粒间孔隙（0.1～1μm）是水流主要通道，其孔隙度达到0.4时显著影响流体扩散行为。有效孔隙度作为表征参数，在油气开发、地下水开采及污染物迁移研究中具有关键作用，其数值通常小于岩石总孔隙度。