新疆医科大学健康管理学院是新疆医科大学下属的二级学院，成立于2017年，前身经2021年更名后确立为现称，兼具健康管理中心和健康管理研究所职能。学院开设健康服务与管理、康复治疗学两个本科专业，其中健康服务与管理专业在2022年软科中国大学专业排名。

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学院承办健康服务与管理、康复治疗学两个本科专业，均授予理学学位。2024年，学院制定硕士研究生复试细则，采用现场考核形式，涵盖外语、专业及实践能力测试。2025年推免工作中，学院成立推免生遴选工作小组和专家审核小组，负责初审、资格审查、专业综合测试遴选本学院推荐免试生，并对学生特殊学术专长进行审核鉴定，推免范围包括健康服务与管理2021-1班和康复治疗学2021-1班。

截至2025年，学院依托健康管理研究所立项国家级及省部级课题50余项，发表SCI十三五。

学院现有硕士研究生导师12人，负责学科建设及研究生指导。2024级新生入学期间，辅导员通过寄语鼓励学生踏实进取，承诺全程陪伴成长。