广东省基础与应用基础研究基金是广东省为加强基础与应用基础研究设立的科技计划专项资金，旨在通过多元化资助体系推动原始创新。2018年，广东省政府出台《关于加强基础与应用基础研究的若干意见》，明确以重大项目为牵引，以重大平台与基地建设为支撑，以面上项目为补充的基础科学资助体系。2019年，该基金项目初步形成从十万到上亿元的多层次资助体系，其中重大项目最高支持额度达5000万元。2021年，广东省基础与应用基础研究基金委员会正式启动，负责基金的专业化管理。2023年，省科技厅印发《联合基金管理实施细则》，规范联合基金运行机制，明确联合资助方可按不超过1:3比例出资，同步试行科研经费“负面清单+包干制”改革。截至2024年，该基金通过省市联合基金等形式支持了包括青年基金、重点项目等在内的千余个项目。2025年实施的《项目管理实施细则》进一步强化其政府性自然科学基金定位，全年收到来自360家依托单位的7803项申报项目。

广东省基础与应用基础研究基金形成了以重大项目、国家联合基金、省内联合基金、省自然科学基金为核心的多层次资助体系。其中，重大项目最高支持额度达5000万元，青年基金项目则为科研人员提供了从十万至百万元不等的资助。

广东省基础与应用基础研究基金委员会（省基金委）作为基金的专业化管理机构，负责项目的评审、立项、监督等工作。2023年，省科技厅印发《联合基金管理实施细则》，规范联合基金的设立与运行，明确联合资助方可涵盖政府部门、企业等主体，资金按不超过1:3比例出资。

基金项目经费自2023年起试行“负面清单+包干制”，依托单位需履行经费管理主体责任，科研人员享有更高自主权。2025年实施的《项目管理实施细则》进一步强化了省基金作为政府性自然科学基金的定位，明确鼓励多元投入机制。