巢房是蜂巢的基本构成单位，由工蜂蜡腺分泌的蜂蜡修筑而成，其正六边形结构经科学验证为最节省材料且空间利用率最高的几何形态。巢房按功能可分为工蜂房、雄蜂房、过渡型巢房与王台，分别承担幼虫哺育、储粮及蜂王培育等不同功用。蜂房底面由三个相同菱形组成，精确计算的角度使其兼具力学强度与容积优势。这种建筑智慧启发了航空航天等领域的仿生应用。

巢房为正六棱柱结构，底面由3个完全相同的菱形组成，每个菱形的钝角为109°28′，锐角为70°32′，经现代科学验证该角度组合能实现容积最大化与材料最省化。相邻巢房的六边形平面相互错位排列，提高整体结构强度。

工蜂在12-18日龄时蜡腺发育成熟，产蜡量达到峰值。通过后足跗节收集蜡鳞片，经口器咀嚼软化后逐层构筑蜂房，在完全黑暗环境中依靠触觉完成六边形结构搭建。蜂群可昼夜建造3000-5000个巢房，新建巢脾厚度约25毫米，含8000-10000个房孔。

六边形蜂房结构已被应用于：

截至2025年，四川科技馆通过'蜂巢空间'展品系统性展示其结构与仿生科技成果。中国蜜蜂博物馆收藏有完整野生蜂巢标本，实测数据显示单个标准工蜂房容量为0.284毫升。