局部免疫是机体在抗原入侵部位优先启动的特异性防御机制，其核心机制包括
微皱褶细胞（
M细胞）对病原的捕获与递呈，以及分泌型IgA抗体在外分泌液中阻断微生物黏附的特异性作用。应答主要发生于
黏膜（如
肠道、
呼吸道）、
皮肤及
淋巴器官（脾边缘区、淋巴结副皮质区）等特定解剖部位，表现为局部T/
B淋巴细胞增殖引起的组织结构改变（如淋巴结肿大、
生发中心形成）和抗原清除效力的空间局限化。2023年专利研究表明，该机制可通过定向诱导应用于特定组织的免疫调节。
微皱褶细胞（M细胞）作为
黏膜免疫系统的专职
抗原递呈细胞，集中分布于回肠集合淋巴小结顶端及扁桃体隐窝上皮。其基底面凹陷形成容纳
淋巴细胞跨细胞运输将入侵抗原直接转运至局部T/B淋巴细胞聚集区。这种空间特化的递呈模式使免疫应答可局限在抗原入侵的初始部位。
分泌型IgA作为黏膜免疫的核心效应分子，通过
J链连接形成二聚体结构，可抵抗消化道蛋白水解酶降解。其空间分布受黏膜淋巴细胞归巢受体调控，仅能通过黏膜上皮细胞间的管状系统分泌至外环境，无法通过血液循环全身扩散。2023年专利研究显示，外源性核苷酸制剂可定向增强黏膜部位IgA分泌水平。
感染部位附近淋巴结肿大是局部免疫应答的典型体征，由抗原刺激引发的T/B淋巴细胞克隆性增殖导致。以腭扁桃体为例，隐窝上皮内浸润的免疫细胞在病原刺激下可形成局部生发中心，其固有层可见大量浆细胞聚集并分泌特异性抗体。
基于局部免疫的定向诱导特性，2023年专利技术提出通过3-OH、5-OH修饰的寡核苷酸组合物激活特定组织部位的γδ T细胞，用于治疗黏膜相关性免疫缺陷疾病。该方法通过调控
淋巴细胞归巢受体表达，可实现免疫效应分子在靶器官的特异性富集。