大数据分析系统国家工程实验室于2017年3月29日成立，由中国科学院计算技术研究所牵头，联合中国科学院大学、中国科学院计算机网络信息中心、曙光信息产业股份有限公司等多家单位共建。实验室旨在突破大数据分析的核心技术瓶颈，研制新一代数据分析平台，推动在科学发现、智慧城市、社会安全等领域的应用。2021年，实验室通过国家发展和改革委员会优化整合评估，更名为“大数据分析系统国家工程研究中心”并纳入国家工程研究中心新序列。截至2025年，该机构仍是中国科学院计算技术研究所科研架构的重要组成部分。

2017年3月29日，大数据分析系统国家工程实验室在中国科学院计算技术研究所正式揭牌成立，由国家发展和改革委员会批复建设。2021年，该实验室通过优化整合评估，更名为“大数据分析系统国家工程研究中心”。2022年6月29日，研究中心举行揭牌仪式暨第一届理事会。

实验室由中国工程院院士李国杰担任首任主任，石勇、程学旗担任副主任。2022年更名后，孙凝晖院士担任中心主任，程学旗任理事会理事长。共建单位包括中国科学院大学、中国科学院计算机网络信息中心、曙光信息产业股份有限公司及国创科视科技股份有限公司。截至2025年，实验室隶属于中国科学院计算技术研究所数据研究部。

实验室重点突破大数据分析系统在理论、架构、算法及接口方面的技术瓶颈，研制第三代大数据分析软件栈。研究方向涵盖工业大数据、交通大数据共性技术，构建数据分析技术生态体系，推动全行业应用发展。