。基底变质岩系的组成及盖层沉积结构（如华北地台的四套基底岩群与古生界海相沉积叠加）是界定地层区的重要标志

。

基底构造特征直接决定地层区的空间展布格局。华北地层区以太古代迁西群、阜平群等四套变质岩系构成刚性基底，控制着古生代海相碳酸盐岩盖层的稳定沉积。扬子地层区前震旦纪基底由崆岭群等中深变质岩组成，其北缘鱼洞子岩群的存在表明基底结构具有显著分区性。塔里木地层区则以托格拉克布拉克杂岩为代表的太古宇基底，与上覆震旦系冰碛岩形成鲜明的不整合接触关系。

华北地层区覆盖中朝地台范围，基底由3800-2500Ma的变质岩群构成，盖层包含中上元古界浅海相碎屑岩和古生代海相碳酸盐岩，中生代陆相沉积仅局部发育。扬子地层区呈现典型三层结构：前震旦纪变质基底（1800-800Ma）、震旦纪-中三叠世稳定盖层（含磷矿层和生物礁灰岩）以及晚三叠世以来陆相断陷盆地沉积。塔里木地层区基底年龄达3000Ma，古生界发育完整海相序列，二叠纪玄武岩喷发事件成为该区重要划分标志。

。这种划分方法既体现基底稳定性差异，又反映显生宙构造演化对地层发育的控制作用。

地层区的划分与地层系统分类存在紧密对应关系。显生宇包含的古生界（寒武系至二叠系）、中生界（三叠系至白垩系）和新生界地层，在不同地层区呈现差异化发育特征。例如华北地层区缺失志留-泥盆系海相沉积，而扬子地层区保留完整的古生代海相序列。太古宇绿岩带含矿性（如鞍山群铁矿）被作为地层区矿产资源评价的重要依据。