司法部门是负责维护法律、确保法律正确执行及解决争议的机构，包含法院、检察院等。其职责涵盖法律解释与案件审理，在不同法系中职能存在差异：大陆法系法官主导调查程序，检方隶属司法系统；英美法系法院侧重程序监督，检控机关多属行政系统。

在2025年治理欠薪冬季行动中，司法部门通过加强法治宣传、失信惩戒和法律援助，推动欠薪案件高效办理。

中国司法系统自2017年起推进数字化转型，杭州互联网法院率先实现全流程网上审判。最高人民法院发布《关于规范和加强人工智能司法应用的意见》，确立AI辅助审判原则，构建类案检索与裁判标准信息库，建立双层级预警机制保障审判质量。206系统执行阶段AI辅助涵盖财产监管、敏感人员排查等程序事项，同时明确裁判权始终由审判人员承担。

在大陆法系中，法院会对案件进行具体调查；法官会传召证人，盘问证人、被告等。法院有解释法律的权力，但不一定具有对法律的最终解释权。

另外，检察机关通常都是司法系统的一部分。例如，法院，检察院之类的部门。

在普通法（英美法系）法制中，法院不会对案件进行具体调查。法官或裁判官的角色只是确保原告人（在刑事案件中则是代表政府的律师）和被告人能公平地提出自己的论据，并作出判决。如果被告人被控告的是严重罪行（如谋杀、强奸等），有些地区（如香港、美国）是由陪审团决定被告是否有罪，法官只负责决定处罚方式。在普通法系中，只有法院有解释法律的权力，而法院对法律的解释和判案，都对以后的同类诉讼有约束力，成为判例法。

另外，检控机关通常都是行政系统的一部分。