反转录转座子
通过RNA中介反转录转座的可动元件
反转录转座子是一类通过RNA为中介完成转座活动的遗传元件。其核心转座机制包含转录生成RNA中间体、逆转录形成cDNA、整合到基因组新位点三个阶段。这类元件广泛存在于真核生物中,占人类基因组20%以上,在玉米等植物中占比可达79.44%。
定义与分类
反转录转座子是通过RNA中间体实现转座的可动遗传元件,其转座过程称为反转座作用。根据编码能力和结构特征分为:
结构特征
典型结构包含以下元素:
以人类Alu元件(SINE类)为例,其长度约300bp,依赖LINE编码的蛋白完成转座。
转座机制
包含两种主要方式:
两种机制均需逆转录酶催化,并导致基因组插入位点产生特征性重复序列。以LINE-1为例,其自主转座可使每代人类基因组产生约1/300-1/100的新突变。
生物学功能
在生物进化中发挥重要作用:
基因组分布与影响
不同物种中的分布差异显著:
此类元件的不当激活可能导致基因组不稳定性,人类约0.3%的遗传疾病与其转座相关。
研究工具与方法
主要检测手段包括:
结合二代测序数据,目前可检测到的最小反转录转座子片段为200bp。研究显示,约37%的人类LINE-1元件因基因组组装不完整尚未被完整注释。
参考资料
反转座子 .知网空间.2024-09-28
科技名词 | 转座子 .腾讯网.2024-12-11
最新修订时间:2025-12-14 00:22
目录
概述
定义与分类
结构特征
参考资料