反向重复序列指两个序列相同的拷贝在DNA链上呈反向排列， 是DNA重复序列的一种类型。反向重复序列散布在整个基因组中，约占人类基因组中占5%，常见于基因的调控区，可能与基因的转录、复制有关。反向重复序列的一种形式是反向排列的两个拷贝间隔着一段序列，另一种 形式是两个拷贝之间没有间隔序列，呈反向串联，这种结构又称回文式序列。

术语简介

反向重复序列 (inverted repeat sequence)：

如图1 GTGCTAA和TTAGCAC构成反向重复序列。在双链DNA中反向重复可能引起十字形结构的形成。（图1上面的序列为反向重复序列，同时，注意到它两条链顺读是一样的，且中间没有间隔序列，因此它是回文序列；图1下面的序列为镜像重复序列。详情参见下文辨析。）

回文结构（palindromic structure）：

在真核细胞染色质DNA分子中，还存在大量特殊的序列，这种结构中脱氧核苷酸的排列在DNA两条链中顺读与倒读其意义是一样的，脱氧核苷酸的排列对于一个假象的轴成180°旋转对称，这种结构称为回文结构。

几种重复序列辨析（非正式名词解释）：