原鲸科（学名：Protocetidae）是鲸目古鲸亚目下已灭绝的海洋哺乳动物科，生存于始新世中期约5000万年前，化石分布于亚洲、非洲及北美洲。该科包含巴基鲸属（Pakicetus）、纳拉鲸属（Nalacetus）及伊克托鲸属（Ictholester）等成员，具有陆生向水生过渡的形态特征：保留骨硬化现象及后肢结构，鼻孔位置后移，颈椎骨缩短，耳骨接近现代鲸类，后肢演化出蹼状结构以辅助水中运动。牙齿成分分析表明其已适应海水环境，可长期在海洋栖息。

历史起源

原鲸科动物均出现在5000万年前，化石分布在亚洲、非洲及北美洲。科学家对于在现今巴基斯坦被发现的走鲸Pakicetus 的了解较多，这个生活在5000-4900万年前的生物化石，虽仅是破碎不全的头骨化石，仍可发现其耳骨十分的明显，喷气孔（鼻孔）已移向后方，具有狭长脑室，且仍具有后肢的动物，可能仍是四足兽。在同时期的印度岩层中发现的化石证据也显示，在早期的鲸类间，已经有着难以想象的高度生态歧异性。最早的鲸类是距今5350万年印度的喜马拉雅鲸。

经过大量的研究，科学家认为原始的鲸类起源于始新世的中兽类动物，而走鲸的化石则体现了这个进化的过程，弥补了中兽类与鲸类之间的空缺。而矛齿鲸则仅发现于德国采石场，它们与古蜥鲸同时生活在古特提斯海中，两者的区别仅仅在体型大小上。