南开大学妇产科学研究院是南开大学与天津市中心妇产科医院于2020年12月25日合作共建的研究机构。该机构聚焦妇产科生物治疗、女性全生命周期健康及生殖调控三大领域，整合院校科研与医疗资源，推动妇产医学与人工智能、精准医学等学科交叉融合，并规划建设医学人工智能研究中心、精准医学研究中心等四大科技研发与转化平台。

南开大学妇产科学研究院旨在充分发挥南开大学学科、科研优势和天津市中心妇产科医院医疗资源优势，聚焦妇产科生物治疗、女性全生命周期发育及健康、生殖调控三大领域，开展联合科研攻关，建设妇产科学系统性科研体系。该研究院将推动妇产医学与其他学科交叉融合，逐步组建医学人工智能研究中心、精准医学研究中心、临床医学评价中心、前沿基础创新与转化医学中心等4个科技研发与转化平台。南开大学与天津市中心妇产科医院将以研究院建设为新的起点，进一步夯实联合办学基础，通过共建师资队伍、课程体系，拓宽院校联合人才培养渠道，在医学教育、科研攻关和医疗卫生服务等方面进一步深化合作。

2011年，天津市中心妇产科医院申报南开大学临床教学基地。

2013年南开大学医学院以临床医学专业七年制理论和临床教学为试点，在天津市中心妇产科医院开展临床见习教学改革。

2017年，南开大学与天津市中心妇产科医院签署战略合作框架协议，天津市中心妇产科医院挂牌成为“南开大学附属妇产医院”。医院长期承担南开大学医学院硕士研究生胎儿医学、妇科生殖内分泌学的课程教学以及专业型硕士研究生的规培，现有南开大学医学院临床医学博士研究生导师3人，临床医学硕士研究生导师4人。2015年双方开始联合培养临床医学博士科学学位研究生，2017年开始联合培养三年制临床医学硕士专业学位研究生。

2020年12月25日，由南开大学与天津市中心妇产科医院合作共建的南开大学妇产科学研究院正式揭牌成立。