南京农业大学密西根学院是经教育部批准的非独立法人中外合作办学机构（教外函〔2019〕39号），由南京农业大学与美国密西根州立大学于2019年5月合作设立。学院开展本科和硕士研究生学历教育，首批开设环境工程、食品科学与工程两个本科专业，以及食品科学与工程、农业经济管理、植物病理学和农业信息学四个硕士专业，实行中美双学位授予机制。

2019年5月20日，教育部正式批准设立南京农业大学密西根学院，明确其为隶属于南京农业大学的中外合作办学机构，办学许可证有效期至2031年12月31日。该学院的设立基于两校自1993年开始的长期合作关系，此前已在植物保护、资源环境等领域开展合作研究。

本科专业设置：

硕士研究生专业设置：

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学位授予实行双轨制：

学院设立研究生国家奖学金与学业奖学金制度，2023-2024学年共有32名研究生获得各类奖学金，其中最高奖项国家奖学金每年评选2人。

科研合作平台亚洲农业研究中心聚焦亚洲地区农业可持续发展课题，2022年联合管理委员会会议确定将其建设为国际性合作平台。2024年年度会议披露，学院已完成教育部中外合作办学评估工作，2025年将启动植物病理学硕士及本科项目招生。

师资队伍由中美双方联合组建，2025年春季学期计划引入多名密西根州立大学教授来华授课。课程体系实行全英文教学，中美学分互认制度允许最多9个学分双向转换。

实行联合管理委员会制度，由南京农业大学副校长和密西根州立大学教务长共同领导。2024年会议审议通过本科项目财务模式、美方线下授课方案等重大事项，明确将推进学院视觉标识系统设计与教务运行机制建设。

本科生每年招生规模为40人（每专业20人），硕士研究生每年招收40人（每专业10人）。2025年硕士研究生复试工作于3月29日启动，考点设在南京农业大学滨江校区。