单病种是指发病原因明确、无并发症或合并症的单纯性疾病，需具备标准化诊疗规范和可量化治愈标准。该类疾病通过制定临床路径实现诊疗流程规范化，涵盖急性单纯性阑尾炎、计划性剖宫产、急性心肌梗死等典型病种。依据《第一批单病种质量控制指标》要求，医疗机构需建立三级管理架构，重点监测住院天数、费用结构、药物使用规范率等核心指标。国家卫生健康委通过单病种质量管理与控制平台推进医疗质量同质化管理，并将其纳入三级公立医院绩效考核体系。

单病种需同时满足以下三项医学标准：发病机制清晰可溯源的单纯性疾病；诊疗过程不产生合并症或并发症；具备明确的治愈判定标准及可控的医疗成本。其特征表现为诊疗行为的可复制性，如急性单纯性阑尾炎手术的临床路径包含术前检查、手术方式、抗生素使用及出院标准等标准化流程。

2020年实施的单病种质量管理体系覆盖51个病种/手术，其中包含：

医疗机构需按《疾病分类代码国家临床版2.0》采集病例数据，2024年南京市第一医院的单病种管理数据显示，急性心肌梗死病例平均住院7.02天，次均费用54,751.29元；剖宫产手术病死率保持0%。

国家卫生健康委建立三级监管体系：

重庆市实施的单病种结算制度将15个病种纳入定额付费管理，采用病例组合支付模式。结算标准包含完整的诊疗过程费用，如急性单纯性阑尾炎手术涵盖术前检查、手术费、麻醉费及术后基础护理费用。该模式通过限定最高支付额度，倒逼医疗机构优化成本结构，2022年三级公立医院考核显示单病种次均费用同比下降5.8%。