初古菌门（Korarchaeota）是基于16S rRNA序列分析确立的古菌分类单元，属于TACK超门核心组成部分。基因组研究显示其代表物种Korarchaeum cryptofilum具有独特的代谢基因，可能参与甲烷循环等生物地球化学过程。系统发育分析表明该门与曙古菌门、泉古菌门等共生于高温环境，但在进化树中保持独立分支地位。

通过16S核糖体蛋白串联构建的最大似然树显示，初古菌门与曙古菌门、泉古菌门共同构成TACK超门。2017年研究表明其在TACK超门内的系统发育位置已通过多基因联合分析确认。2020年综述明确指出该门是继广古菌门后第三个独立划分的古菌类群。

2016年完成测序的Korarchaeum cryptofilum基因组显示：

宏基因组学研究（2018）发现其基因组具有：

2020年综述指出该门可能参与：

近年研究发现：

系统发育分析提示：