支链是有机化合物中母体碳链或碳环上的侧枝结构，其存在显著影响化合物的物理化学性质与命名规则。在烷烃系统命名中，主链需优先选择含最多支链的最长碳链，并通过最低系列规则确定取代基编号。支链烷基（如甲基、异丙基）作为取代基广泛存在于药物分子结构中，例如五氮杂大环复合物抗癌制剂中的R6甲基支链，丙型肝炎抑制剂中的2-甲基-1-氧代丙基支链。支链烃还可构成自组装肽的主链分支结构。反刍动物甲烷抑制剂中支链碳链的取代基团呈现多样化特征。

支链指与母体碳链或碳环直接相连的侧枝结构，其碳骨架可为直链或分支形式。支链取代基包括但不限于：

在肽类化合物中，支链可形成于α碳原子上，如缬氨酸的异丙基通过α碳连接主链。约75%的有机化合物含有支链结构，其中C1-C6支链占比超过60%。

2024年公开的药物专利显示：

自组装肽类材料通过支链调控性能：

支链长度对机械性能具有非线性影响：C3支链（如丙基）材料抗拉伸强度较C1支链材料提高40%，但继续增至C6时强度下降12%。