中国动物学会两栖爬行动物学分会是中国动物学会下属学科分支机构，成立于1982年12月，现设八个专业委员会，秘书处常设于南京师范大学。该分会聚焦两栖爬行动物学研究与保护，定期举办全国性学术会议，会员覆盖全国27个省级行政区，承担国家野生动物保护政策咨询及栖息地评估等技术支撑工作。

中国动物学会两栖爬行动物学分会按会章规定每5年召开一次代表大会，进行委员会换届，通常每年或二年举行一次学术讨论会，先后在成都、广州、南京、福州、大连、遵义、汾水关、杭州、芜湖、桂林、温州、长沙、哈尔滨和呼和浩特等地召开。参与和主持的工作主要有：2009年10月，受国家林业局野生动植物保护与自然保护区管理司委托，赵尔宓院士主持、李丕鹏教授具体负责，在南京组织相关专家研讨《国家重点保护野生动物调整目录》，审查国家林业局野生动物保护名录，提出修订意见；2010年7月，受铁道部委托，相关专家就合福高铁安徽泾县县城设站对扬子鳄保护区的潜在影响进行评估，提出施工方案修订意见；2011年7月在浙江永嘉主办了鼋的鉴定和自然放归工作；2011年8月，受环境保护部委托，有关专家对全国两栖爬行动物分布数据进行复审；2011年9月，有关专家受CI邀请对中国蛇类物种濒危等级进行审定；2014年12月份受环境保护部委托，有关专家对全国两栖爬行动物濒危等级进行审定。会员在PNAS、MBE、Evolution、Molecular Ecology、American Naturalist、Molecular Phylogenetics and Evolution、Oecologia、Ecology Letters和Biological Review等国际知名期刊发表300余篇SCI论文。2011年，推荐的中山大学张鹏教授获得了中国动物学会第四届青年科学奖，并作为中国动物学会推荐人选候选中国青年科技奖。先后出版了《贵州两栖类志》、《贵州爬行类志》、《云南两栖类志》、《辽宁两栖爬行类志》、《浙江两栖爬行类志》、《安徽两栖爬行类志》、《两栖爬行动物图鉴》和《内蒙古两栖爬行动物志》等。发表了多篇有关扬子鳄（Alligator sinensis）、鳄蜥（Shinisaurus crocodilurus）和大鲵（Andrias davidianus）等濒危动物的研究论文，并成功地建立了扬子鳄和大鲵的饲养种群，还对陕西大鲵增殖放流效果做出了评价并对影响因素做了相应分析。1996年首次发表应用随机扩增多态性DNA技术的论文，1998年有基于龟类核苷酸序列的系统学论文发表，之后在国内外重要刊物发表了多篇学术论文。接待了多个国家和代表团的来访并进行学术交流，派团和专家赴国外参加各类国际自然和自然资源保护会议、世界两栖爬行动物学大会、亚洲国际两栖爬行动物学术讨论会和中俄两栖爬行动物学大会等，与国外同行进行学术交流，通过交流了解国外学科进展，促进了国内的学科发展。2012年，和成都生物研究所在成都召开第五届亚洲两栖爬行动物学大会。2016年，承办在杭州召开第八届世界两栖爬行动物学大会。