两界系统是由瑞典自然科学家
林奈在18世纪提出的生物分类体系，主张将生物划分为
动物界和
植物界两大类。该分类以生物能否自由运动、是否进行光合作用为主要标准：植物界包含具有固着生长、自养特征的生物，如
藻类、
真菌及
高等植物；动物界涵盖异养且能自由运动的生物，包括
原生动物与多细胞动物。
根据这种分类方法，凡有绿色叶片，可以进行光合作用，制造有机物，根生于土中，不能自由运动，并能无限生长的就是植物。所以，真菌当时就归入了植物界。与此相反，能自由运动，不营光合作用，以植物或其它有机物为营养物质，并有限生长的，都属动物界。
1972年，爱尔曼和狄德摩（P．L．Altman and D．S．Dittmer）仍然主张按林奈的传统分类法把生物分为两界，植物界包括细菌、蓝藻、绿藻、金藻、褐藻、红藻、粘菌、真菌、苔藓和维管束植物。动物界包括原生动物和多细胞动物。