世界顶级科学研究中心计划，简称WPI，日文名称为世界トップレベル研究拠点プログラム，英文名称为World Premier International Research Center Initiative，是日本文部科学省于2007年启动的科研支援项目。该计划全称“世界顶级国际研究基地形成促进计划”，通过集中资助建设国际化研究基地，重点支持东北大学、东京大学、京都大学等机构开展跨学科融合研究。截至2023年，共有17个研究中心入选，涉及材料科学、结构生物学等领域。

知识竞争日趋白热化的时代中，为了让日本以科学技术领先世界，优秀人才的国际化交流是重要的一环。为此需要建立能从全世界聚集人才、开放型的研究中心。

由此，日本文部科学省从平成19年度启动了世界顶级科学研究中心计划。该计划的目标是建设以高水平研究者为核心的世界一流的日本研究中心。日本政府为此进行集中支援，以促进成员机构自主地导入系统改革，进而吸引世界一流的研究者，促成优良的研究环境和较高的研究水平。

东北大学材料科学高等研究所（AIMR）

东京大学Kavli数物连携宇宙研究机构（Kavli IPMU）

京都大学物质-细胞统合系统中心（iCeMS）

大阪大学免疫学前沿研究中心（IFReC）

物质・材料研究机构国际纳米构造学研究中心（MANA）

九州大学碳中和能源国际研究所（I2CNER）

筑波大学国际统合睡眠医科学研究机构（IIIS）

东京工业大学地球生命研究所（ELSI）

名古屋大学多变生物分子研究所（ITbM）

东京大学神经智能国际研究机构（IRCN）

金泽大学微生命科学研究所（NanoLSI）

北海道大学化学反应创成研究中心（ICReDD）

京都大学人类生物学高等研究中心（ASHBi）

高能加速器研究机构量子场计测系统国际中心（QUP）

日本文部科学省于2007年启动了世界顶级科学研究中心计划。迄2020年，通过该计划日本已逐渐形成了一批能与世界顶级研究机构比肩、具备卓越研究能力且面向国际化、走入全球视野的日本顶级研究机构。