上位基因是遗传学中描述不同基因位点间相互作用的核心概念，指一个基因的存在会掩盖或影响另一基因的表型效应。根据显隐性差异，其可分为上位显性基因和上位隐性基因。与显性不同，上位效应表现为不同基因位点的调控关系，而非同一基因的等位互作。典型案例如小鼠毛色遗传中，基因C的缺失（cc）会完全遮蔽基因B的作用，导致表型呈现白色。

上位基因（epistasis）指通过调控其他基因表达路径来遮盖或改变其表型效应的基因。根据作用形式差异，可分为两类：

上位效应与显性机制存在本质差异：

以小鼠毛色遗传为例：

该机制揭示了基因互作中层级调控的重要性，上位基因通过掩盖或影响另一基因的表型效应，决定下游基因能否表达。