三公曹是西汉成帝时期设立的尚书令下属官署名。初置时为尚书五曹之一，主要负责处理三公文书及刑狱诉讼事务，与常侍曹形成分工以缓解文书压力。东汉光武帝时期调整职能，转为考核州郡官员年度政绩，曹魏时期该官署遭裁撤，西晋初年恢复后重新执掌司法审判，北魏时三公曹直接参与审判事务。三国至南北朝期间，三公曹与二千石曹共同掌管囚账记录，为隋唐刑部制度奠定基础。十六国时期西秦政权曾短暂复置该机构。

东汉三公曹改主岁终考课州郡事，辞讼改归二千石曹。魏、晋沿置。