核仁小分子RNA（snoRNA）是真核生物细胞核仁中60-300核苷酸长度的非编码RNA，具有box C/D、box H/ACA及MRP RNA三种保守结构分类。其主要功能包括指导rRNA前体的2'-O-核糖甲基化修饰、假尿嘧啶化修饰，以及参与核糖体亚基组装。基因组织形式呈现物种差异性，脊椎动物主要通过内含子编码，而植物多形成多顺反子基因簇。近年研究发现snoRNA功能失调与癌症发生相关，部分类型可作为肿瘤诊断标志物和治疗靶点。

snoRNA根据保守序列分为三类：

所有类型均通过与核蛋白（snoRNP）形成复合体发挥功能，其中C/D型结合fibrillarin蛋白，H/ACA型结合dyskerin蛋白。

核心功能包括：

存在四种编码方式：

截至2025年研究显示：

研究发现宿主基因GAS5编码的snoRNA在乳腺肿瘤中表达下调，而Zfas1编码的snoRNA通过促进细胞周期进展影响乳腺癌发展。核仁外功能研究揭示snoRNA通过生成sdRNA参与基因沉默。